일반적으로 식물은 자연적이기 때문에 위험이 적을 것이라고 생각하지만, 이것은 사실과 다르다. 일부 식물은 약용으로 사용하기에는 독성이 많은 경우가 있다. 일반적으로 안전하다는 일부 식물들도 간 또는 신장에 피해를 줄 수 있다. 의약품처럼 약초치료는 특정 의약품 또는 식품과 함께 먹었을 때 치명적인 반응을 가져올 수 있다. 식물을 가장 안전하고 최대의 효과를 가지고 사용할 수 있는 지침은 아래와 같다. * 위험하다고 알려진 약초는 먹지 않는다. 위험이 있다면 알려져 있는 식물은 피하는 것이 가장 최선이다. 예를 들어 chaparral, comfrey, life root, germander, coltsfoot, sassafras 그리고 ephedra(ma huang) 등은 피한다. * 광고에 현혹되지 않는다. 미국 연방법은 약초치료제 제조업자가 자신의 상품이 직접적인 치료효과를 가져온다고 광고하는 것을 금지하고 있다. 그러나 제조업자들은 종종 자신들의 상품이 광범위한 범위의 질병을 안전하게 치료한다고 선전한다. 제조업자들의 주장을 곧이 곧대로 듣지 않아야 한다. 정직한 제조업자들은 종종 자신들의 상품에 대해 아무런 건강주장을 하지 않기 때문이다. * 믿을 만한 정보를 찾는다. 의사들은 약초에 대해 많이 알지 못하며 약사들 역시 마찬가지이다. 건강식품점 직원은 많이 아는 것처럼 보일지 모르지만 종종 약초치료제 제조업자로부터 들은 정보가 다 일 경우가 많기 때문에 공정하다고 보기 힘들다. * 자격있는 전문의의 도움을 받는다. 자연요법사를 찾아가는 것도 좋다. 기본적인 의약 훈련뿐만 아니라 자연요법사는 약초를 안전하게 사용하는 광범위한 지침을 가르쳐 줄 것이다. * 표준화된 추출물만을 구입한다. 표준화된 약초 추출물은 활동 성분 또는 특별한 농축액 성분을 제공하기 위하여 처방되어 왔기 때문에, 생산품이 약효가 좋고 사용에도 안전하다는 확신을 가지게 되었다. 상표에 "표준화된" 또는 "독일 표준"이라는 표시가 있는 것을 찾는다. * 신중하게 지시대로 복용한다. 약처럼 약초도 특정양을 복용해야만 효과가 잘 나타난다. 권장양만을 복용하고, 식사와 함께 먹는지 공복시 또는 물과 함께 먹는지 등을 지시에 따라 복용한다. * 약초와 의약품을 섞어서 복용하지 않는다. 약초가 다른 약의 효능과 연관이 있기 때문에, 만일 조제약을 먹고 있다면 의사 또는 자연요법사의 검진을 받을 때까지 약초 추출물을 복용하지 않는 것이 좋다. 만일 의사가 약을 처방한다면, 복용하고 있는 약초에 대해 말을 한다. 양을 재조정해야 할 필요가 있을지도 모르기 때문이다. * 알레르기 반응을 유의한다. 약초를 한 번에 하나씩 이용한다. 두 번째 약초는 첫 번째 약초가 일정기간 동안 현기증, 두통, 발진 또는 배탈 등의 알레르기 반응이 보이지 않을 때 첨가한다. 어떠한 알레르기 반응이라도 나타나면, 즉시 약초 복용을 중단한다. 일주일 뒤 다시 복용해본다. 다시 같은 증세가 나타나면 완전히 중단한다. 약초 복용 후 숨이 가빠라지면 즉시 응급 조치를 해야 한다. * 임신 중에는 약초를 먹지 않는다. 식품으로 많이 사용하는 마늘, 생강 그리고 다른 약초들은 일반적으로 별문제가 없다. 그러나 다른 약초들은 임산부에게 심각한 문제를 일으킬 수 있다. 12세 이하 아동에게 약초를 먹을 때에는 반드시 의사와 상의하는 것이 가장 좋다.