종이 대신 컴퓨터 소프트웨어나 인터넷 웹사이트를 통해 세금보고를 하는 납세자가 늘어나자 온라인 세금보고를 활성화시키기 위해 많은 노력을 기울리고 있는 IRS는 온라인 방식을 처음 이용하는 납세자들도 5자리의 개인 ID 번호로 서명을 대신할 수 있도록 하는 등의 방안을 마련해 놓고 있다. 또 온라인 세금 보고를 위한 소프트웨어는 기존의 개인용 컴퓨터에 다운로드를 통해 사용하던 방식에서 웹사이트에서 어카운트를 지정해 사용하는 방식으로 상당부분 전환되고 있다. 이를 이용하면 개인의 재정관련 정보가 중앙 서버에 저장돼 사용자는 패스워드를 통해 이용할 수 있으며 저렴한 비용으로 사용할 수 있다. 그러나 온라인 세금보고 방식은 몇가지 문제점으로 인해 일반 납세자는 물론 공인회계사들에게 아직까지 큰 인기를 얻지 못하고 있다. 우선 개인의 신상정보가 인터넷을 통해 전달됨으로써 유출 가능성을 배제할 수 없으며, 이 과정에서 일부 마케팅 회사들이 자신들의 영리 목적으로 누출된 정보를 이용할 수 있다. 세금보고 소프트웨어를 선정할 때는 몇가지 고려돼야 할 사항들이 있다. 온라인 세금보고를 하는 납세자들 가운데는 아직도 데스크탑 다운로드형을 사용할 지 인테넷용을 사용할 지 결정하지 못한 경우가 있다. 인터넷을 사용하면 비용을 절약할 수 있으나 웹서버가 항상 연결돼 있지는 않는다는 점을 고려하면 안정성이 떨어진다는 점을 간과해서는 안된다. 또한 데스크탑용을 쓰기로 했더라도 디럭스 버전이냐 스탠다드 버전이냐의 선택을 결정해야 한다.